Uma abordagem multiômica fornece informações sobre a gravidade da gripe – ScienceDaily

Você já se perguntou por que algumas pessoas podem ficar mais doentes do que outras, mesmo quando pegam o mesmo vírus? Ainda não está claro por que isso acontece. Fatores virais (como diferenças na cepa de um vírus) desempenham um papel nessa variabilidade, mas não podem explicar a ampla gama de respostas em diferentes indivíduos infectados pelo mesmo vírus. Um número de fatores de acolhimento também foram considerados, incluindo imunidade pré-existente, idade, sexo, peso e microbioma.

Outro fator importante é a biologia molecular dentro de suas células. O DNA é mostrado como uma longa fita dupla-hélice. Assim, você pode esperar que a célula sempre leia a informação genética em ordem, começando em uma extremidade e indo para a outra. Mas este não é o caso. DNA contém elementos transponíveis às vezes chamado de “DNA lixo”, que pode alterar as regiões do genoma que estão sendo lidas em um determinado momento.

A obra publicada em Genômica Celular por uma equipe internacional liderada pelo Dr. Guillaume Bourque, que estudou o papel desses elementos transponíveis na gravidade da doença após a infecção pelo vírus influenza A.

Ao examinar dados de 39 indivíduos antes e depois da infecção pelo vírus influenza A, os pesquisadores foram capazes de identificar mudanças na acessibilidade (ou seja, a “legibilidade”) dos elementos transponíveis. Para fazer isso, os pesquisadores usaram uma abordagem que combina vários conjuntos de dados multiômicos, que caracterizam e quantificam coleções de biomoléculas em células ou organismos. Um deles era o transcriptoma, que consiste em todas as cópias de RNA transcritas a partir do DNA na célula. O outro era o epigenoma, que é a coleção de mudanças químicas no DNA que modificam a expressão gênica. Uma vantagem dessa abordagem multiômica é que eles foram capazes de identificar famílias de elementos transponíveis com mudanças na acessibilidade, o que provavelmente passaria despercebido por abordagens anteriores.

Ao considerar essas mudanças nos elementos transponíveis após a infecção viral, eles puderam identificar vários fatores de transcrição (proteínas que ativam ou desativam genes específicos) que provavelmente contribuem para a resposta de alguém à infecção. Usando essas descobertas, os pesquisadores foram capazes de criar um modelo que poderia prever a carga viral de um indivíduo após a infecção por influenza A.

“Uma série de questões permanecem, como se a ligação entre os elementos transponíveis e a carga viral é realmente causal e se essas mudanças seriam consistentes ao longo do tempo”, diz o principal autor Xun Chen. “Mas essas descobertas são um passo importante para entender o papel que esses fatores desempenham na variabilidade da gravidade da doença entre os indivíduos”.

Os autores incluem pesquisadores da Universidade de Kyoto, no Japão, da Universidade McGill e da Université de Montréal, no Canadá, e da Universidade de Chicago, nos Estados Unidos.

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