Uma equipe internacional liderada por pesquisadores do Baylor College of Medicine com o Consórcio de Comunicação de RNA Extracelular dos Institutos Nacionais de Saúde e o laboratório Bogdan Mateescu da ETH Zürich e da Universidade de Zürich desenvolveu um novo recurso poderoso para estudar o RNA extracelular (exRNA), um novo forma de comunicação célula a célula. O estudo, publicado na revista Genômica Celularestabelece as bases para examinar como o exRNA e suas proteínas transportadoras encontradas em fluidos corporais funcionam em um ambiente saudável e doente, potencialmente fornecendo um meio para implementar com precisão a detecção precoce e monitorar os processos de doenças.
“O ácido ribonucleico ou RNA é um tipo de material genético que está presente dentro de todas as células vivas. É mais conhecido por atuar como um mensageiro carregando instruções codificadas no DNA para a síntese de proteínas”, disse o co-autor correspondente, Dr. Aleksandar Milosavljevic, professor e presidente de Henry e Emma Meyer em Genética Molecular em Baylor. Ele também é diretor do Programa de Pós-Graduação em Biociências Quantitativas e Computacionais e membro do Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center em Baylor. O Milosavljevic Lab é o anfitrião do exRNA Atlas, o repositório de recursos e gerenciamento de dados do Extracellular RNA Communication Consortium, um projeto do NIH Common Fund que explora a biologia do exRNA.
Nos últimos anos, a pesquisa mostrou que o RNA não apenas existe dentro das células, mas também é exportado das células como RNA extracelular e desempenha um papel na comunicação célula a célula.
“Os ExRNAs existem em fluidos corporais fora das células, onde podem se associar a uma variedade de transportadores, incluindo proteínas de ligação ao RNA (RBPs), mas a carga e a distribuição de RBPs nos biofluidos são amplamente desconhecidas”, disse o coautor Robert Fullem, estudante de pós-graduação no Laboratório de Milosavljevic. “Nosso objetivo neste estudo foi preencher essa lacuna. Essa grande lacuna no conhecimento limitou nossa compreensão do papel dos RBPs como portadores de exRNA em fluidos corporais humanos. Nossas descobertas abrem um novo caminho para a compreensão da biologia do exRNA e fornecem novas oportunidades para a desenvolvimento de biomarcadores de biópsia líquida exRBP/exRNA.”
Os pesquisadores aplicaram análises computacionais para identificar exRBPs no plasma, soro, saliva, urina e líquido cefalorraquidiano. As previsões computacionais foram validadas experimentalmente em cerca de 80% em culturas de plasma e células em laboratório, sugerindo alta especificidade para o método computacional.
“Com esta informação, desenvolvemos um mapa de candidatos a exRBPs e sua carga de exRNA em fluidos corporais, expandindo a paisagem de potenciais biomarcadores que agora podem ser estudados em biópsias líquidas e usados para rastrear processos normais e de doenças”, disse Milosavljevic. “Apresentamos este mapa como um recurso disponível gratuitamente para a comunidade científica.”
Outros colaboradores deste trabalho incluem os co-primeiros autores Emily L. LaPlante e Alessandra Stürchler, David Chen, Anne C. Starner, Emmanuel Esquivel, Eric Alsop, Andrew R. Jackson, Ionita Ghiran, Getulio Pereira, Joel Rozowsky, Justin Chang, Mark Gerstein, Roger P. Alexander, Matthew E. Roth, Jeffrey Franklin, Robert Coffey, Robert L. Raffai, Isabelle M. Mansuy, Stavros Stavrakis, Andrew deMello, Louise C. Laurent, Yi-Ting Wang, Chia-Feng Tsai, Tao Liu, Jennifer Jones, Kendall Van Keuren-Jensen e Eric Van Nostrand.
Esta publicação foi parcialmente financiada pelo NIH Common Fund (1UG3TR002881-01, 1U54DA036134-01,1U54DA049098-01, 1U54DA049098-01S1, 1UH3TR002881, OT2OD030547-01S1 e 5UG3TR002881-02). Apoio adicional foi fornecido pelo CPRIT Scholar in Cancer Research grants RR200040, 4UH3CA241703-03, e um Swiss National Center of Competence (NCCR) em Research RNA & Disease grant.